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培養基倒轉放置，最根本的原因是因為培養基中的水份在備用儲存期間或培養過程中會蒸發出來，倒置可以防止培養基過分失水干裂或縮小，避免培養基的成分(鹽分等)濃度變大，滲透壓發生變化不利于細菌生長。

1、防止污染，空氣中細菌會沉降，倒置后就不怕了。培養基往往會有水份蒸發，不倒置可能會有水滴掉下來，也容易污染

2、有利于菌落出現，倒置后，瓊脂表面不會殘留水份，否則有水的話，細菌在表面生長成菌膜，菌落難以出現。

3、方便取拿，正放拿起來很容易只拿蓋子吧，那樣就會增加污染機會。

另外需要注意的是，培養皿設備使用前必須經過清潔消毒，可以先使用熱肥皂水洗刷，然后用流水沖洗，再用1%～2%鹽酸溶液進行浸泡，以除去培養皿表面的游離堿，之后再用水沖洗。培養皿清潔與否對工作影響較大，可影響培養基的酸堿度，若有某些化學藥品的存在，會抑制細菌生長。